قصة انمي Phantom in the Twilight تقع في لندن الحديثة، وتتحدث في عالم تولد فيه “الظلال” من الخوف والقلق البشري. فتاة شابة تأتي للدراسة في الخارج، يقع لها حادثة غريب عندما تبدأ الدراسة في الجامعة. في مدينة لا يوجد لديها معارف فيها، تجول الفتاة التي لا حيلة لها في مقهى “Café Forbidden”، وهو مقهى غامض يفتح أبوابه في منتصف الليل. تلتقي بمجموعة متنوعة من الرجال الوسيمين العاملين في المقهى، حيث يجتمع الحراس الذين يحمون الحدود بين البشر والظلال.