قصة انمي Ansatsu Kyoushitsu 2nd Season تتمة لاحداث الموسم السابق وتدور القصة بعد عودة الطلاب لاستكمال الدراسة في النصف الثاني للسنة الدراسية بعد أعمالهم البطولية في الجزيرة أثناء العطلة الصيفية. تابع الفصل 3-E شحذ أسلحتهم مع إبقاء أنظارهم على معلمهم “كورو-سينسي”. كما أصبح لديهم الكثير للقلق بشأنه إضافة لكونهم قلقين من معلمهم نفسه، ومع ذلك، فإن الأعداء القتلة، القدماء منهم والجدد يسعون للحصول على رأس الأخطبوط. وعلاوة على ذلك، يقف المنافسين من الفصل A مع مدير المدرسة جنبا إلى جنب لمنع طلاب الفصل E من تحقيق علامات مدرسية عالية. ولكن المجموعة تواصل العمل سويّا للتغلب على الأعداء واغتيال معلمهم بنجاح.